與處理中使用的藥劑，包括混凝劑、助凝劑、氧化劑、還原劑、阻垢劑等，尤其是混凝劑和阻垢劑，這些藥劑的選擇、加藥量甚至藥品配方法都會對反滲透的運行有很大的影響。通常，我們會注意檢測進水的鐵含量，其實進水中的鋁含量高也會造成反滲透膜的污染。鋁對膜的污染是由于氫氧化鋁沉淀而導致的，氫氧化鋁沉淀物通常以膠體形式存在，是一種兩性氫氧化物，在6.5-6.7的pH范圍內具有很小的溶解度，如果鋁凝聚過程在太高或太低的pH值下進行，鋁離子將進入反滲透裝置中造成反滲透膜的污染，因此對于采用鋁鹽為凝聚劑的預處理系統，其pH值建議控制在6.5-6.7，使鋁的溶解度達到小，注意根據水質及時調整加藥量，可能的話要定期檢測經預處理過的水中的鋁含量，并控制在0.05mg/L以下。
2、溫度可能大家都知道溫度對反滲透膜元件的通量有很大的影響，因此在計算產水量的時候對溫度進行校核才能相互比較。所以在冬季水溫低的地方反滲透的預處理系統中會設計加熱設備，這樣可以有效保證冬季反滲透設備也能達到設計出力。
3、反滲透設備運行人員的培訓
運行人員的既能水平的高低、取決于運行人員能否及時發現并正確處理系統的缺陷和隱患是影響反滲透設備運行的重要因素。運行人員的誤操作對系統的危害更大，而且對這種膜元件的損壞常常是無法恢復的。反滲透設備重啟前和運行后的沖洗工作一定要做好，防止設備中有殘余氣體在高壓下運行，形成氣錘會損壞膜，以及膜濃水側的無機鹽的濃度高于原水，易結垢而污染膜。
